Veselé historky genetické, nejen pro Ptakopyska

Publikováno | Autor:

Matzurka

Asi všichni tušíte, že nejsou všichni biologové stejní, dokonce ani genetici. Někteří se zabývají rostlinstvem (botanikové), jiní zvířenou (zoologové), a i genetici si volí objekty svého zkoumání dosti často podle svých oblíbených rostlin či zvířat. Jsou to pak takoví hybridi (tedy ti kříženci zoolog x genetik či botanik x genetik), kteří jsou dnes vesměs označováni buď jako genetici evoluční (je-li jím bližší genetika) nebo molekulární ekologové (přeci jen je víc baví běhat v terénu a nahánět své budoucí vzorky). No, a jelikož občas není snadné rozhodnout, o jaký ulovený druh se jedná (popisem druhových rozdílů se zabývají taxonomové, to už je další sorta vědců, schopných si zapamatovat množství nezáživných informací zvící telefonního seznamu Mexico City), vydumali ti genetičtí koumáci tzv. DNA barcoding, neboli čárový kód na základě kousku DNA. Představit si to je poměrně jednoduché, řetízek DNA tvoří jen 4 různé báze ve specifickém pořadí, pro jednoduchost si je lze znázornit třeba barevnými korálky na šňůrce, přičemž je tam navlékáme ve zdánlivě náhodném pořadí (ve skutečnosti to pořadí určuje strukturu bílkovin). Pokud bychom to pak z obou stran zducli, tak to vytvoří barevný čárový kód, obdobný tomu černobílému na zboží v každém superhyper. Důležité na tom koumání bylo zjistit, který kousek kterého genu bude zrovna tak proměnlivý, aby se na jeho základě dalo určit, že zkoumaný objekt je třeba ježek východní a ne západní.

Tento rozlišovací kousek DNA, dále mu říkejme standardně „marker“, byl objeven celkem nedávno, v podstatě na přelomu tisíciletí. Předcházela tomu řada studií, které používaly řadu jiných markerů, a když už jich bylo opravdu, ale opravdu hodně, si pár lidí sedlo na zadek a začalo to množství informací třídit, až se jim vyloupl ten dnes používaný DNA barcoding.

Jednou z těch předcházejících studií byla i práce doktorů zoologie/genetiky Bakera a Palumbiho, kteří ve své době měli za cíl najít markery pro velryby. Jak je dobře známo, velryby jsou loveny a pojídány, ovšem je jich čím dál tím méně a mnohým druhům začíná hrozit vyhynutí (vlastně sežrání hladovým druhem Homo sapiens). Mezinárodní velrybářská komise proto požádala oba výše uvedené vědce, aby jim trochu pomohli, neb komisi se přeci jen zdály některé balíčky s masem na asijských trzích podezřelé. Oba kolegové projevili dobrodružného ducha, neboť aby neporušili zákon o zákazu vývozu masa z ohrožených druhů, odcestovali do Japonska s velkým kufrem, v němž bylo zapůjčené „cestovní“ laboratorní vybavení (firma věděla, jak se dělá marketing), a v hotelovém pokoji si udělali provizorní laboratoř. Pak se vypravili na nákupy, a donesli si celou škálu produktů označených „velryba“ od masa sušeného, soleného, marinovaného v sezamovém oleji či sójové omáčce, až po čerstvé řízky. Z tohoto materiálu extrahovali DNA, a pak připravili onen „marker“. Ten už se vyvážet může, takže přesnou sekvenci, tedy pořadí oněch barevných korálků, určily laboratoře na Novém Zélandu a v USA. Nooooo… konec si jistě domyslíte, ze 16ti vzorků jich bylo 5 z chráněných druhů, a další tři pocházely z delfínů a mořské želvy (což se sice asi lovit může, ale klamání zakazníků se přece nedělá). O něco později byla provedena podobná studie ve větším rozsahu, ta už zahrnovala i nákupy z Koreje, a z celkového počtu 954 vzorků jích bylo 773 opravdu z velryb (z toho zhruba 9% z chráněných druhů), zbytek opět z delfínů, želv, ale i ovcí a koňů. Ňam !

DNA Barcoding se tímto a dalšími případy stával stále více populárním, takže dnes existuje obrovská porovnávací databáze, používaná pro ledacos. Ovšem u zrodu tohoto projektu stál pro změnu zoolog/genetik kanadský, dr. Hebert. I jemu se podařil hezký kousek….

V r. 2007 si jedna paní v Chicagu koupila na asijském tržišti dvě mražené ryby („ďas mořský”), a uvařila z nich rodince dobrou polívčičku (příprava zahrnovala očištění, vykuchání a 7 hodin máčení ve studené vodě). Paní si dala pořádný nášup, manžel i dcerka si dali pár misek (dcerka spíš jen mističku), načež se rodičům udělalo velmi nedobře. Paní zvracející, s otupělostí a brněním v okolí úst, celkovou slabostí a bolestí na hrudníku přijali do nemocnice, manžel měl naštěstí příznaky slabší, takže byl ponechán v domácí léčbě, dcera byla bez příznaků. I začalo horečnaté hledání zdroje nemoci, takže byly zbytky kůže a vnitřnosti podrobeny chemické analýze; vyšetřování se zaměřovalo na tetrodotoxin, obávaný nervový jed. Samozřejmě že se do toho vložil federální zemědělský úřad, který má mimo jiné v popisu práce také dohlížet na kvalitu dovážených potravin. I strhla se mela převeliká, prací téměř detektivní byl zjištěn prodavač i další ochody, které obdržely stejnou či obdobnou zásilku s nevinným označením „ďas mořský, vykuchaný a bez hlav, vyprodukováno v Číně“. Kromě chemiků ty zmraženiny posuzovali i zoologové taxonomičtí, ale došlo i na dr. Heberta. Jemu byly zaslány rozvařené zbytky masa z oné polévky…. a mělo to dobrý konec, neboť i on na základě genetického markeru potvrdil podezření ostatních zúčastněných, že šlo o jedovaté čtverzubce, v Japonsku známé jako poněkud adrenalinová mlsota „fugu“. Paní se uzdravila po třech týdnech, manžel mnohem dříve, a dr. Hebert dnes stojí v čele nadnárodního konsorcia pro DNA Barcoding s cílem přidělit kódy všemu živému, co na této planetě pobíhá. Databáze je dnes obrovská, ale ukazuje se, že platí jen na živočichy, a ještě ne všechny. Ale nebojte se, pracuje se i na markerech pro další organismy, takže ve tmě tápat nebudeme.

A teď hezky do postýlek…. vlastně ne, pokud byste měli zájem nebo vás trápil nějaký prťavý živočich, kterého lze odchytit a v lihu zaslat k analýze, můžete se mi ozvat – tuhle identifikaci děláme s mými studenty v rámci výuky, a mnohdy je to rychlejší, než se dopídit specialisty taxonoma na tu či onu zvířecí skupinu (neboť na rozdíl od něho genetici neběhají v terénu mimo dosah signálu).

 

PS.

Oba uvedené případy jsou zdokumentované v odborných publikacích, pdf v AJ je volně k získání a mohu přeposlat.

Příspěvek byl publikován v rubrice Nezařazené a jeho autorem je Šumavák. Můžete si jeho odkaz uložit mezi své oblíbené záložky nebo ho sdílet s přáteli.

839 komentářů u „Veselé historky genetické, nejen pro Ptakopyska“

  1. no jo, už se těším, až bude prezidentem Zeman (Lesník) dvojitá duha se rozeklane a národ bude šťastný. Úplně to didím v barvách technicoloru 😀

  2. Andy, jakejma, to je přeci jedno, duch blogu musí být zachován a stará parta táhne za jeden provaz. Takže dřív bylo…pan prezident Klaus má vždycky pravdu, teď je to téma, Lesník a jeho špinavý, špinavý…. špatný vliv na kotlinu, příště bude něco jiného. V podstatě se nejedná o nic mimořádného, stará parta imperialistům nenalévá.

  3. třeba že je nezatížený žádnými kostlivci této vlády, že dosud za žádné průsery neodpovídal a tak…..prostě dočista dočista…..
    Jo a taky samozřejmě netrpí stihomamem, že ten druhej křupan a Klaus jsou komplotisti atd…..

  4. 452- ale ne, jirko, na tohle já nehraju. Jen mne zajímají ty nesmysly, zatím to vypadá, že se KS jen brání útokům, i když ti nacisti a emigranti se fakt povedli.

  7. Andy, jasně, taky si myslím, že to s tou starou partou je pitomost, ale znáš to, nešlo odolat….Na druhou stranu, už jsem psal, že mne bude těšit, že když Zeman něco udělá, co se mi nebude líbit a napíšu to zde, tak se ihned ozve spartááááá. Což by mi chybělo a nerozuměl bych odezvě, protože na souhlas nejsem zvyklej 😀

  8. K volbě prezidenta budu mít jenom jednu poznámku (víc doufám ne):
    Dosud mi byl mírně sympatičtější Lesník – nikoliv však natolik, abych ho volil. Po jeho hlášce o komp(l)otu K+Z se v mých očích sundal na stejnou čáru s Křupanem.
    U mě to je tedy zatím nerozhodně, asi jako jestli si mám vrazit rezavej hřebík do levý nebo pravý nohy.
    Nevidím dosud důvod jít ani jednoho volit.

  9. Tak snad kdyby mi ještě někdo vysvětlil, jaký politický důvod vládu k tomu nákupu vedl?

    …„Je to naprostý nesmysl. Rozhodnutí o pořízení letounů CASA bylo rozhodnutím vlády. Policie nemůže jednoho člena vytáhnout a obvinit ho, protože šlo o politické rozhodnutí. Byl by to jedinečný precedens, kdyby jeden člen vlády nebo všichni byli obviněni kvůli politickému rozhodnutí,“ řekl (Schwarzenberg) loni v červnu…
    http://www.novinky.cz/domaci/290750-kvuli-kauze-casa-vypovidal-schwarzenberg-na-policii.html

  11. 459: Rputi, za to může Klaus, už to na novinkách nebo idnes psali.
    Byl by to dobrý precedens, pokud vláda kryje podvod a lumpárnu, tak je postavit před soud. Snad je parlament vydá ke stíhání, když vydali Bártu. Píši „pokud“, protože nevím. Nejlépe by udělali, kdyby všichni ministři té doby požádali o zbavení imunity a očistili se před soudem 🙂 Kdo nic neudělal, nemusí se přece naší justice obávat.

  12. Napsal bych vam co zpusobyl kandidat na presidenta na Islandu, tvrzenim ze existuji letajici ryby ( islandsky areo rybuee) nestacil ani preplavat fjord a musel emigrovat do Danska!!! Ale pocitam ze by se to obratilo proti me, tak toho radsi necham . . .

  13. Brouku, když Vás tu tak vidím, slyšel jsem, že jste si založil stáj speciálně pro koně určené na výrobu smyčců pro vídeňské filharmoniky. Nepředpokládám, že to je nějaká pomluva, protože to by bylo velmi šklivé, ale tím směřuji k mé otázce, uslyším smyšce již na letošním plese, Nebo snad až příští rok?

  14. Jíirko, andy, přestaňte blbnout.

    Napsala jsem jen, že mojí máti, paní ve věku 88 let nevadí na knížeti totéž,co jí vadilo na Okamůrovi. Připadalo i to jako docela názornej příklad, jak je to s argumentem, že někdo není Čech.

    Pokud jde o nesmysly, tak komploty Zemana a Klause a jak si mohl mladej Klaus dovolit urazit knížete a jak ho tatínek dosadil na telé místečko na PORG – Klausovic rodiuna je momentálně pro máti nepřítel č.1, i když byly doby, kdy ho obdivovala. A už se „těším“, jak si vyslechnu, co za mizeru je ten Dejdar, když nepodporuje knížete a že dobře mu tak.

    Je to jen pohled do názorů jednoho voliče. Teoretického, protože máti do volební místnopsti sama nedojde a přiznám se, že ačkoliv ji jinak zařídíme první poslední a dovezeme ji, kam chce, i přítelkyni, která k nní chodí na návštěvu brácha vozí domů, aby nemusela autobudem a vždycky si vyslechne, jak je důležitý toho knížete volit, aby to tu neuchvátili komunisti, vyslechne, tak odvoz k volbám jsme ani já ani brácha nenabídli.

    A vůbec to nebylo o tom, jetsli je nebo není kníže dobrej nebo špatnej.

    Možná byste si měli připustit, že některý lidi prostě toho Zemana volit budou a třeba ani ne z nějaké lásky ke komunistům, ale protože kníže jim vadí víc. Nebo lidi, co se na něj nalepili.

    Jirko, zřejmě trpíš představou, že kdokoliv si dovolí mít jiný nnázor než Ty, je sparťan. Musím Tě vyvíst z omylu, já nejsem sparťan, neb se o fotbal nezajímám.
    Ostatně jetsli Losna nebo Mažňák, je mi taky šumák.

  15. tucnaku jsme na tom skoro podobne.
    akorad mne to dalsi vystupovani ( i cele rodiny VK – tedy az na sestru) trochu prevazuje ze to hodim knizeti ( od ted budu psat jak andy KS protoze se mi nechtelo vypisovat to skarede jmeno 🙂 )

  16. nickname 461 – já jen, že mi nikdo neřek, že plánujeme vojenskou alianci se Španělskem… 😀

  17. No, poruším předsevzetí 🙂 a budu reagovat:
    Pepo 465 – uvědom si, prosím, že je značný rozdíl, jaké dehonestace soupeře se dopouští osobně kandidát, a jaké melou „fanoušci“ (např. rodina VK). Jinými slovy, Zeman neni odpovědnej za Klausovo kecy.
    Tímto si u mě Lesník zhoršil situaci, ničím jiným …

  18. 464 maYdo, to musíte pochopit!
    Babička je vážný politický protivník a Jirka proti ní bude bojovat do roztrhání těla nebo zničení klábosnice. 🙂

  20. Musim vas pane kolego zklamat, nestacili jsme obarvit(Rot-Weiss-Rot) je nepsana povinost, tak snad az pristi rok…..ale jeden nejmeovany rakousky politik si objednal trenky z dotycnych zini, tak budem prece jen zastoupeni aspon takhle(a ano zkusil jsem ,a prijemne kousou)……

  21. Rputi,

    já mám dojem, že babička s Jirkou politický názor sdílí. 🙂

    Je to knížecí fanynka. Zrovna tak jako její přítelkyně. Jsou schopný si navymejšlet úplný nesmysle – viz hláška typu “ co si to ten mladej Klaus dovoluje, tatíček ho upíchl ve škole a on si teď o sobě moc myslí“.

    Nojo, babky nejsou dědkové, aby drbaly o fotbalu, tak mají volby.

    Ale myslím, že až jí povím, že jsme dceři koupili společenské šaty a že se chystá do tanečních, zapomene na veškerou politiku. 🙂

  22. tucnaku to mas pravdu.
    ale mi se nelibi ani jeden a volit pujdu.
    koukam tedy i na vyjadreni okolo zkousim to tak nejak hledat komu na cem zalezi

  23. Hmm, tak volební tým Zemana vytasil na Schwarzenberga hákové kříže. 🙁

    To už fakt všichni přehání.

  24. Tak to je škoda Brouku. Ale nevadí, budu se těšit tedy na další rok. Sice mne trošičku vadí, že ten „box“ si nemohu, jako nečlen monarchie, dovolit objednat přímo, ale znáte to, nastrčil jsem kolegu, který má správný původ, který mi to zařídil, tedy doufám, že to udělá i na příště.

    Ty žíněné trenky je asi vyšší vývojový typ, než ty původní kopřivové, přišel jsem na to?

  26. Pavle (473), hlavně se mi líbí, jak zastánci přímé volby tvrdili, že to nebude taková žumpa jako v patlamentu …

  29. No já se právě té mnohem větší žumpy bál. Ale že to bude až takový hnus ?
    Tak nějak jsem si myslel, že volební týmy kandidátů na presidenta republiky budou mít alespoň elementární slušnost.
    Z obou stran je to neuvěřitelný humus. 🙁

  30. Prisel jste na to pane kolego naprosto presne.
    Co se tyce „loze“ klidne se name obratte, mam abanomo do roku 2020 ,a byla by to myslim prijemnszmena povsech tech prestarlejch peinceznach,a hrabatech . .
    Jeste me ,pane kolego prozradte co me to napadlo, psat na blogy natelefonu ?! Asi jsemchtel bejt zajimavej . . .

  31. pánové, já jsem rád, že existuje přímá volba prezidenta, stejně tak bych uvítal i další přímé volby a to včetně místního šerifa, či referendumů, jaká jsou ve Švýcarsku. Vono se to samozřejmě srovná a ještě pár desítek let a bude to férovější.

  32. hřebejk si stoupl za dejdara
    doufám, že umělci umí za ranní rosy střílet ostrými
    když jich bude polovina, stále jich bude dost

    a přestávám číst diskuze, protože za všechno můžou pražáci
    zemanovci nadávají
    schwarzenbergerovci nadávají
    kdo se nás zastane?? PI

  33. 481
    pokud vyhraje kníže, žádná švýcarská referenda nebudou, neb je výslovně odmítl 🙂

  34. hmmm,
    soudím, že naškrobit takové žíněné trenky, aby měly puky, nebude jednoduché. Předpokládám, že tajemství škrobení žíní bude v rodině Herr Woracka z otce na syna děděno jako dědičný úřad škrobitelů žíní už od doby Ferdinanda I. Habsburského. Tuhle jsem v auerspergském rodinném archivu o tom našel zmínku. Povozník Herr Woracek nedaleko Dolního Dvořiště probodl naškrobenou koňskou žíní najatého vraha ohrožujícího císařský majestát Ferdinanda I. právě když se Jeho Výsost za křovíčkem připravovala na celní a pasovou kontrolu v Gmundu. Vděčný vladař jej na místě pasoval na dvorního škrobitele žíní s dědičným titulem k. und k. HofAmylMeister a vzal jej s sebou do Vídně.

  35. 2 Pavel Kořenský – ad 469 – ale musíš uznat, že je ten Stránský takový zásadový člověk, učiněný demokrat, který si za všech okolností stojí za tím, co řekl.
    Vzácný to charakter… Ryzí demokrat a opora občanské společnosti!

  36. Jirko – jasně. A přiznivci jedné strany dostanou červeně natřené kriketové pálky a příznivci druhé strany modře natřené. Po pár referendech či volbách tu nebude nikdo, kdo by volil 🙂

  37. 479- u mně ještě pořád převažuje zhnusení nad poslední nepřímou volbou prezidenta- výhružky, extrémní lži, poslušnost při hlasování kontrolující Jacques a psychopatické výbuchy senátorů o kulkách v poště.

  38. pane kolego, …. není to telefonem, ale tabletem, jehož jsem nadšený uživatel a beru ho většinou všude sebou, když musím z kanceláře, nebo když mám rozdělanou práci a nechce se mi přepínat obrazovky…
    No a pokud bude zpívat u nás vás v Opeře jeden můj vzdálenýej známej , od P, než tedy poletí za moře, doufám, že jsem nic neprozradil, nemám problémy se tam dostat, ale ples je holt ples, to je našlapanější.
    Jinak vy jistě víte, jak je to s tím dalším plesem, jak to pracovně nazývám ..dortíčkovým, který je ihned po tom velkém. Má cenu na něj zůstávat? To víte, v mém věku a manželčině stavu, jestli dvě noci za sebou protančit, není příliš.

  39. PeSi – jo, ten rozhovor je takovej, jak by řekla mladá „dost hustej“. 🙂

  40. Pavle, bohužel musím oponovat – červenopálkaři budou neoprávněně zvýhodněni, protože oběma stranám poteče červená 🙂

  41. Správná poznámka. Tak dobře, žluté kriketové pálky.

  42. hele anemůžou mít všichni stejnou barvu? Vždyť by to bylo levnější, množstevní slevy a tak….ono by to přeci bylo úplně jedno 😀

  43. 469
    ten rozhovor je fakt hustý
    kam se nám ti demokrati(čerchmanti) schovali?
    jsou demokraty jen do doby, dokud mají ostatní shodný názor.

  45. ad 490 -nevěřím! Jedné straně musí téci modrá… 🙂

  46. LOL:

    Tý – Bolek, koho volíš ?
    – Knížete, né. Cos myslel, vole ?!?
    Tak tu máš Othella aji Desdemonu. Bo ti dva šulíni co je hráli, volí Zemana.
    – Tý vole, já nemám kozy – jak mám hrát Desdemonu ?
    Něco vymyslíš, vole. Se zeptej třeba Lábusa….tý, Bolek – koho vlastně volí Lábus ?
    – Zemana nebo Schwarzenberga – jeho postoje sú dosud nejasné.
    Bolek, zajdi za Lábusem, domluv s ním ty kozy a nech mu podepsat totok prohlášení šlechty. Zítra to chcu mít s podpisem na stole… a tebe s kozama v Národním.

    🙂

  47. Jirko – stejný barvy ? No to by teda rozhodně nešlo, to by se na dálku nepoznali. 🙂

  48. No jo, modrou kref jsem nedomyslel …
    Tak bude asi nejlepší varianta 492 – všichni stejně a pálky (s trikolórou) budou díky množstevní slevě třikrát dražší.

  49. pánové, nic proti žíněným trenkám, ale pokud vím, žíněnou košili nosili kajícníci, aby odčinili hříchy svoje i světa. Kajícný efekt způsoboval fakt, že taková košile neustále škrábala, takže nositel neměl ani pomyšlení na darebnosti.

    ale nakonec, Jirkoa asi ví, zač se chce kát 😀

    mimochodem, Jiří? Jak to „při manželčině stavu“ ? To už zas?

  50. no jirko referendum , prima volba , divadlo , hnus.

    no ja jak se tak v noci pretacel a potil se ( asi to tomu dost pomohlo) jsem celou noc poslouchal projevy poslancu pri pokusu sesadit vladu.

    myslis ze ti zvoleni jsou na vyssi urovni nez ti co voli ?

Komentáře nejsou povoleny.