Veselé historky genetické, nejen pro Ptakopyska

Publikováno | Autor:

Matzurka

Asi všichni tušíte, že nejsou všichni biologové stejní, dokonce ani genetici. Někteří se zabývají rostlinstvem (botanikové), jiní zvířenou (zoologové), a i genetici si volí objekty svého zkoumání dosti často podle svých oblíbených rostlin či zvířat. Jsou to pak takoví hybridi (tedy ti kříženci zoolog x genetik či botanik x genetik), kteří jsou dnes vesměs označováni buď jako genetici evoluční (je-li jím bližší genetika) nebo molekulární ekologové (přeci jen je víc baví běhat v terénu a nahánět své budoucí vzorky). No, a jelikož občas není snadné rozhodnout, o jaký ulovený druh se jedná (popisem druhových rozdílů se zabývají taxonomové, to už je další sorta vědců, schopných si zapamatovat množství nezáživných informací zvící telefonního seznamu Mexico City), vydumali ti genetičtí koumáci tzv. DNA barcoding, neboli čárový kód na základě kousku DNA. Představit si to je poměrně jednoduché, řetízek DNA tvoří jen 4 různé báze ve specifickém pořadí, pro jednoduchost si je lze znázornit třeba barevnými korálky na šňůrce, přičemž je tam navlékáme ve zdánlivě náhodném pořadí (ve skutečnosti to pořadí určuje strukturu bílkovin). Pokud bychom to pak z obou stran zducli, tak to vytvoří barevný čárový kód, obdobný tomu černobílému na zboží v každém superhyper. Důležité na tom koumání bylo zjistit, který kousek kterého genu bude zrovna tak proměnlivý, aby se na jeho základě dalo určit, že zkoumaný objekt je třeba ježek východní a ne západní.

Tento rozlišovací kousek DNA, dále mu říkejme standardně „marker“, byl objeven celkem nedávno, v podstatě na přelomu tisíciletí. Předcházela tomu řada studií, které používaly řadu jiných markerů, a když už jich bylo opravdu, ale opravdu hodně, si pár lidí sedlo na zadek a začalo to množství informací třídit, až se jim vyloupl ten dnes používaný DNA barcoding.

Jednou z těch předcházejících studií byla i práce doktorů zoologie/genetiky Bakera a Palumbiho, kteří ve své době měli za cíl najít markery pro velryby. Jak je dobře známo, velryby jsou loveny a pojídány, ovšem je jich čím dál tím méně a mnohým druhům začíná hrozit vyhynutí (vlastně sežrání hladovým druhem Homo sapiens). Mezinárodní velrybářská komise proto požádala oba výše uvedené vědce, aby jim trochu pomohli, neb komisi se přeci jen zdály některé balíčky s masem na asijských trzích podezřelé. Oba kolegové projevili dobrodružného ducha, neboť aby neporušili zákon o zákazu vývozu masa z ohrožených druhů, odcestovali do Japonska s velkým kufrem, v němž bylo zapůjčené „cestovní“ laboratorní vybavení (firma věděla, jak se dělá marketing), a v hotelovém pokoji si udělali provizorní laboratoř. Pak se vypravili na nákupy, a donesli si celou škálu produktů označených „velryba“ od masa sušeného, soleného, marinovaného v sezamovém oleji či sójové omáčce, až po čerstvé řízky. Z tohoto materiálu extrahovali DNA, a pak připravili onen „marker“. Ten už se vyvážet může, takže přesnou sekvenci, tedy pořadí oněch barevných korálků, určily laboratoře na Novém Zélandu a v USA. Nooooo… konec si jistě domyslíte, ze 16ti vzorků jich bylo 5 z chráněných druhů, a další tři pocházely z delfínů a mořské želvy (což se sice asi lovit může, ale klamání zakazníků se přece nedělá). O něco později byla provedena podobná studie ve větším rozsahu, ta už zahrnovala i nákupy z Koreje, a z celkového počtu 954 vzorků jích bylo 773 opravdu z velryb (z toho zhruba 9% z chráněných druhů), zbytek opět z delfínů, želv, ale i ovcí a koňů. Ňam !

DNA Barcoding se tímto a dalšími případy stával stále více populárním, takže dnes existuje obrovská porovnávací databáze, používaná pro ledacos. Ovšem u zrodu tohoto projektu stál pro změnu zoolog/genetik kanadský, dr. Hebert. I jemu se podařil hezký kousek….

V r. 2007 si jedna paní v Chicagu koupila na asijském tržišti dvě mražené ryby („ďas mořský”), a uvařila z nich rodince dobrou polívčičku (příprava zahrnovala očištění, vykuchání a 7 hodin máčení ve studené vodě). Paní si dala pořádný nášup, manžel i dcerka si dali pár misek (dcerka spíš jen mističku), načež se rodičům udělalo velmi nedobře. Paní zvracející, s otupělostí a brněním v okolí úst, celkovou slabostí a bolestí na hrudníku přijali do nemocnice, manžel měl naštěstí příznaky slabší, takže byl ponechán v domácí léčbě, dcera byla bez příznaků. I začalo horečnaté hledání zdroje nemoci, takže byly zbytky kůže a vnitřnosti podrobeny chemické analýze; vyšetřování se zaměřovalo na tetrodotoxin, obávaný nervový jed. Samozřejmě že se do toho vložil federální zemědělský úřad, který má mimo jiné v popisu práce také dohlížet na kvalitu dovážených potravin. I strhla se mela převeliká, prací téměř detektivní byl zjištěn prodavač i další ochody, které obdržely stejnou či obdobnou zásilku s nevinným označením „ďas mořský, vykuchaný a bez hlav, vyprodukováno v Číně“. Kromě chemiků ty zmraženiny posuzovali i zoologové taxonomičtí, ale došlo i na dr. Heberta. Jemu byly zaslány rozvařené zbytky masa z oné polévky…. a mělo to dobrý konec, neboť i on na základě genetického markeru potvrdil podezření ostatních zúčastněných, že šlo o jedovaté čtverzubce, v Japonsku známé jako poněkud adrenalinová mlsota „fugu“. Paní se uzdravila po třech týdnech, manžel mnohem dříve, a dr. Hebert dnes stojí v čele nadnárodního konsorcia pro DNA Barcoding s cílem přidělit kódy všemu živému, co na této planetě pobíhá. Databáze je dnes obrovská, ale ukazuje se, že platí jen na živočichy, a ještě ne všechny. Ale nebojte se, pracuje se i na markerech pro další organismy, takže ve tmě tápat nebudeme.

A teď hezky do postýlek…. vlastně ne, pokud byste měli zájem nebo vás trápil nějaký prťavý živočich, kterého lze odchytit a v lihu zaslat k analýze, můžete se mi ozvat – tuhle identifikaci děláme s mými studenty v rámci výuky, a mnohdy je to rychlejší, než se dopídit specialisty taxonoma na tu či onu zvířecí skupinu (neboť na rozdíl od něho genetici neběhají v terénu mimo dosah signálu).

 

PS.

Oba uvedené případy jsou zdokumentované v odborných publikacích, pdf v AJ je volně k získání a mohu přeposlat.

Příspěvek byl publikován v rubrice Nezařazené a jeho autorem je Šumavák. Můžete si jeho odkaz uložit mezi své oblíbené záložky nebo ho sdílet s přáteli.

839 komentářů u „Veselé historky genetické, nejen pro Ptakopyska“

  3. je parada jak se to tu prolina.

    no ze neco ukradli bohacum – je spatne ale dano dobou az spravne protoze to stejne nakradli !!! Dulezite je to podlozit treba dekrety benese.

    ze ted neco mohou ukract obcanum CR – je spatne az trestne . ac by to muselo byt podlozeno zakony a soudy.

    ze by za to ukradene mohli mit nekteri obcani CR mensi duchody a davky – je svetova krivda a je potreba CR dat pod ochranu cara.

    jo ze jde vzdy o to stejne – neni ochranen majetek obcana – je jedno .

    Proc ? protoze nemec.

  5. Pepo, clovce, taky ti pripada, ze jedina idea od roku 1918 tedy od vzniku republiky je zasadni a naproste vymezeni vuci jiznim sousedum? V podstate nic jineho nestmeli narod tak, jako sudetsky ledrhoze v Mnichove, ci film o cisarovne Sisi 😀
    Na druhou stranu, musim pripustit, ze jakakoliv idea statu je dobra, coz jsem taky napsal uz davno a i dnes.

  6. 2 Foundry – ad 384 – No asi je zná osobněji… Já je znám jen ze Skutků apoštolských…
    No a to hodnocení Klause má svou logiku – už Grossman si chtěl pošpitat s diváky o spojeným nádobí…
    Jinak – těch „von“ znám několik osobně, co se věnují vědě… A s fenoménem silného euroskepticismu a silné eurokritičnosti jsem se setkal u většiny z nich.

  7. jirko mozna by si vsichni meli zkusit tak obektivne v soukromi ( ne psat to by se nesmelo zverejnit ) projit kdo jejich rodinam a rodum vic a vickrat ublizil.

    byli to vic nemci? cesi? rusi?

    vis ona idea statu je super – ale taky si ten stat musi uvedomit co je a muze.

    stejne jako ja si musim uvedomit ze asi nemam na to co ten bill od voken tak by si asi i ta kotlina mohla uvedomit kde stoji.
    dulezite je aby mi nebylo moc braneno se snazit , prodavat jabka a setrit dolar k dolaru az toho voknare predezenu.

    ja vim zkusit mu to sebrat pod zaminkou idee statu je cesta rychlejsi ale nekdy muze narazit.

  8. nickname,
    jako bývalý obyvatel Ledče nad Sázavou jsem motokrosem takměř odkojen. Ten mi nevadí. Ale nahoře ve vsi je famílije, jejíž synové vlastní obchod s terénními motocykly. A oni sami se projevují tak, že na kroskách jezdí na jaře po čerstvě zasetých polích, a když plodiny povyrostou, nasednou na vysokootáčkové rejže s motorem na principu náhodných výbuchů a rvouce tyto na plné otáčky, jezdí mi trasu dlouhou dva kilometry po silnici před barákem sem a tam třeba celé odpoledne. Jediné, co na ně zabírá, že si na tu silnici stoupnu s vidlema. Mmch, když slyším ty vyladěné motory, divím se, že ještě nezkrachovali.
    Když už beru motocykly do klábosnice, já se mám ještě fajn, ale obyvatelstvo úseku Košetice až Červená Řečice to má ještě lepší. Tam se jim shromažďujou silniční motorkáři a serpentýny na trase jezdí jednotlivě i ve skupinách na čas. Když jedu do Pelhřimova, tak trnu, kolik debilů proti mě vyletí v protisměru a co udělaji.

  9. Ledče nad Sázavou? Hele, odtamtud byl můj otec. Teď tam jezdím párkrát za rok na hřbitov a pokaždé čekám, že kvůli tomu debilnímu příjezdu na náměstí skončím v obchodě s nábytkem a pak taky na tom krchově.

  11. 385
    jen připomínám, že tehdejší premiér paroubek z rakouska zavelel, aby policie zasáhla razantně!
    jako vždycky se pomýlil a místo vděku se dočkal demonstrací

  12. Češi zvolí svého von Neuratha sami, a budu se srdečně smát, až Jeho Jasnost …kristepane, Baubo, jestli bolševici vyhrajou výrazně volby, tak asi panu Schwarzenbergovi( všímáte si, že jak on, tak my feudalisté zásadně nepoužíváme pro KS tituly? Nepotřebujeme je urážet) nic jiného nezbyde. Možná kdyby se pravice(ehm) tak nesnažila bolševikům hrát do noty a navíc je pečlivě chránit, aby nemohli být zakázáni, tak by se vlády už nikdy nedočkali.
    Možná…vlastně zcela určitě.

  13. Andy,
    jo, ledečskej hřbitov…. Mám pocit, že kromě několika hřbitovů v Cornwallu, je tenhle snad jedinej v Evropě, kde jsou hroby vykopaný do skály. Ale co by člověk chtěl od města, kde je kostel v největším dolíku záplavového území, zámek si přestavěli na hrad a kvůlivá dvoum barákům mají půlku města jako památkovou zónu…

  14. Divano, tak si říkám, že když se pan Schwarzenberg rozhodl pro kruhovou obranu a najednou ostřeluje pana Klause i pana Zemana, asi bude mít problém. Co když naštve bývalé voliče Klause i Zemana a oni demonstrativně hodí hlas Schwarzenbergovi?

    Pan Paroubek to projel díky agresivitě. Pana Schwarzenberga se také povedlo vyprovokovat.
    Uvidíme, co ještě vytvoří mediální mágové.

  15. Odkazy:
    http://www.novinky.cz/domaci/290759-zeman-s-klausem-tvori-mocenskou-skupinu-tvrdi-schwarzenberg.html
    Prezidentský kandidát Karel Schwarzenberg v neděli v Olomouci uvedl, že jeho protikandidát Miloš Zeman vytvořil mocenskou skupinu s prezidentem Václavem Klausem. Oběma jde prý pouze o udržení moci. Podle Schwarzenberga jde o podvod na voličích.

    Nebo je nervózní kvůli paní Parkanové?
    http://www.novinky.cz/domaci/290750-kvuli-kauze-casa-vypovidal-schwarzenberg-na-policii.html

  16. nikcname, ano
    vždycky je zajímavé sledovat naštvaného protivníka, tam se nacházejí ty ukryté černé díry

  17. no a kalousek jako obvykle při volbách je neviditelný

  18. 413- mně se ten hřbitov líbí, je takový…klasický. Rodina má hrob hned u dolní brány, tak se vždycky dívám na panorámata- když jsme tam jezdili za prarodiči, ještě nestály paneláky a bylo to pěkné. Dneska je Ledeč trochu šílená díra…děd toužil po tom, abychom se my dcerky provdaly za inženýry z Kovofiniše a žily tam, ale nám to připadalo jako osud horší než smrt, jak se říká:)

  19. Jó, není nad to, když se pravda k lásce vine – to se pak dílo daří…
    http://www.lidovky.cz/skoncili-jsme-s-nim-vzkazuji-tvurci-zdivocele-zeme-stransky-a-bocan-dejdarovi-kvuli-zemanovi-ifv-/lide.aspx?c=A130118_184836_lide_jkz

    „Tvůrci populárního seriálu Zdivočelá země se naštvali na protagonistu hlavní role Martina Dejdara. Režiséra Hynka Bočana a scénáristu Jiřího Stránského rozlítila hercova podpora Miloše Zemana v blížícím se druhém kole prezidentských voleb. „Skončili jsme s ním,“ píší Stránský s Bočanem.“

    Inu, není nad demokracii a odpor k jakékoli formě diskriminace. Že? A hlavně se kochám, jak nám ta pravda a láska tak hezky vítězí nad lží a nenávistí…

  20. Andy,
    já na ten hřbitov nahlížel z pohledu hrobníka 😀 Tuhle profesi bych v Ledči vykonávat nechtěl. A Kovofiniš? Kde je mu konec… Ono je to umění položit monopolního výrobce galvanických linek a lakoven ve východní Evropě. A přitom ten pán, co se mu to povedlo, byl zvolen v těch rušných poplyšákových dobách místními revolucionáři za ředitele. Když jsem odtamtud odcházel, byla u banky zastavena i kovofinišácká kanalizace. A ten komunistickej neschopa, co byl revolucionáři sesazen, si každou chvíli kupuje nový vidle na přehazování peněz, který vydělal, založiv si ihned po sesazení firmu a pustiv se ruče do práce. Teď by se zchudlým revolucionářům mohl smát do xichtu, kdyby chtěl.
    No a od té doby se to v Ledči furt takňák sere.

  21. ptakopysku nebo ti hrobnici mji zkusenost .
    rozdelaji ohen pak to zaliji vodou – tak pokracuji az je hrob dost hlubokej.

  22. (383) no jo, Matzurko, ideály jsou krásné, když se o nich debatuje v univerzitním kroužku; jak se začne s jejich realizací, jsou to samé průšvihy nepravidelně po sobě jdoucí 🙁

  23. Hm, tak koukám že to bere dobrej směr….

    Jak vidno, kníže má opravdu našlápnuto k tomu, aby národ spojoval, když má tak oddané fanoušky…

    a co teď udělají s tou Zdivočelou zemí? nechají Maděru popravit a pokračovat budou o potomcích, ctících jeho odkaz? Ale ono to asi došlo ( já to nesleduju, takžeb nevíkm) už někam skoro do devadesátých let, ne?

    No, mohlo by ho klepnout nad opoziční smlouvou. To by byl takový hezký závěr. Alkorát by se to muselo natočit s nějakým dvojníkem, když s tím darebákem Dejdarem pánové skončili.

  24. pepo,
    mám takovej matnej dojem, že voheň jo, bez vohně by nehořelo cígo, ale voni se hrobníci spíš nalejvaj, nez zalejvaj a spíš rumem, než vodou.

  25. Ad 419 – no já jsem vždycky říkal, že přímá volba presidenta je blbost. Ale že to nabere až takový grády, to mně opravdu nenapadlo. To už je jak za komančů, kdy od jisté doby nemohla jít v TV Noc na Karlštejně, protože v ní hrál Matuška.

  27. 425- podle mne to žádné velké grády nenabralo, holt billboardy od dálnic mizí, prachy na kampaň došly, tak se jede podle levnějšího modelu.

    426- zřejmě tu amnestii nenapsal nikdo- a mně se přitom docela líbí. Pořád čekám na nějakou zástupcovskou státní a soudcovskou sebereflexi, že se se vším tak serou…a furt nic.

  28. Rputi,
    psssst! To psal ten Koudelka z STS Chvojkovice – Brod

  29. Nestranný komentátor na ČRo Lukáš Jelínek mluvil o Zemanovi-Klausovi „každý chvilku tahá pilku“, nešťastném vyjádření o dekretech – vyhaslý x neplatný. Ani slůvkem se nezmínil o Haagu. Ještě že si platíme těch 9mld. kč/rok za nezávislá veřejnoprávní média.

    Někdo se upálil na václaváku u Muzea nebo Na můstku.

  30. nickname nejsem vstoupenec pravda a lasky ani socialismu demokraticky nedemokratickeho.
    ale videl bych tu snahu obou stran o stejnou nevyvazenost kde to jen jde.

    ze se to chytila cela rodina klause mne jenom prekvapilo.

    My pasacci co se ale neucime z historie ty niance proste nechapeme.

  31. a na sportu biatlon, našíííííí … nevidím ale placky

  34. 2 Pavel Kořenský – ad 425 – a nemohla jít Zlatovláska, protože tam zase hrál Tříska…
    Ale nelze přece srovnávat štvavou propagandu Matušky a Třísky vůči pracujícímu lidu, která byla oprávněně zatrhnuta se situací, kdy si támhle nějakej Dejdar demokraticky otevře hubu a nerespektuje kolektivní rozhodnutí Národní fronty – pardon, umělecké…
    S takovými živly je přece třeba řádně zatočit, asi jako před časem zatočil Svěrák s Vondruškou…
    Aneb, jak pravil Čenda Krchov:
    „Lidu se povolila uzda. Což ovšem já, Čenda Krchov, nepovažuju za docela správný. Soudruzi, vždyť dneska nám do všeho mluví každej. Řeknu vám, já jsem viděl dokonce i němýho, kterej ukazoval rukama úplně jinak než před krátkým časem. Týhletý povolnostě využívaj různí živlové a elementi k naleptávání jednoty.“

  35. A spolu s Pupákem bych rád popřál lidem, aby co nejdříve znovu získali svobody Prosincové ústavy z roku 1867, která zaručovala svobodu osobní, tiskovou, spolčovací a shromažďovací.

  39. pravice bránila zákazu komunistů ….. bože do čeho sto duši dal ????
    Jednak tady byli lidi okolo Wendy Hafela s jejich hysterickým humanismem, druhak tady byla vždycky levicová většina (která volila právě Havla, pak jančila okolo různých model typu Švejnara a spol. a teďka se lokajsky cpe do imaginární záře nobility Kalouskova fořta) a třeťak se místní rektoskopové snažili dostat do Euroříše vedené už v té době (prý) bývalými maoisty…
    Kde tady někdo vidí příležitost pravice (ať už si pod tím představujeme cokoliv) k možnosti zákazu komunistů ??
    Tak snad marťani….

  41. 439- neprskejte, šimone, já také nehodnotím vaši osobu…vono svádět všechno na Wendu Hafela fakt nejde. Jeden si leccos pamatuje.

  44. Zkuste si to přečíst pořádně – nešlo jenom o toho Wendu….
    A to vyprsknutí bylo smíchy…..

  45. martine kdo poslouchal pravnika blazka jak presne voli slova co mu rekl koudelka- musi vedet ze byl koudelka u pripravy amnestie 😀

    ono nekdy kdyz nechteji pravnici lhat tak voli tak presne krkolomne vyjadreni ze je jasne ze vse ostatni se stalo

  46. No je to takové hezké Andy…bejvalé politikové, členové stran, se teď bijou v prsa, když už jim nic nehrozí, že ty komunisti jsou fuj a když byli aktivní, tak o nich nebylo ani vidu, ani slechu….
    Ale to je normální, nic jiného od nich nečekám.

    Ten Tomášovo článek se mi docela líbil. Ostatně příspěvky o tom, že kdo nežije v kotlině, nemá co kecat, se objevujou tady taky, i když sporadicky o poznání méně častěji, než na Novinkách….

  47. tedy nehrozilo jim nic ani tehdy, snad jen to, že by se navrh zákazu a další postihy ve vztahu komunisté a stát začali líbit více a oni je museli nějak prakticky „udělat“ 😀

  49. Moje máti nechtěla volit okamůru,protože prý je napůl cizinec. U knížete, který má je taky napůl cizinec, jí to nevadí a papouškuje všechny nesmysly, kterým jeho fanoušci krmí veřejnost.

    TAk se v tom vyznejte… Ostatně v případě máti jsem ráda, že se těší takové duševní svěžesti, že ji ty volby ještě vůbec v jejím věku zajímají, jakkoliv jsou její argumenty poněkud mimo.

  50. kterým jeho fanoušci krmí veřejnost.- například?

Komentáře nejsou povoleny.