Veselé historky genetické, nejen pro Ptakopyska

Matzurka

Asi všichni tušíte, že nejsou všichni biologové stejní, dokonce ani genetici. Někteří se zabývají rostlinstvem (botanikové), jiní zvířenou (zoologové), a i genetici si volí objekty svého zkoumání dosti často podle svých oblíbených rostlin či zvířat. Jsou to pak takoví hybridi (tedy ti kříženci zoolog x genetik či botanik x genetik), kteří jsou dnes vesměs označováni buď jako genetici evoluční (je-li jím bližší genetika) nebo molekulární ekologové (přeci jen je víc baví běhat v terénu a nahánět své budoucí vzorky). No, a jelikož občas není snadné rozhodnout, o jaký ulovený druh se jedná (popisem druhových rozdílů se zabývají taxonomové, to už je další sorta vědců, schopných si zapamatovat množství nezáživných informací zvící telefonního seznamu Mexico City), vydumali ti genetičtí koumáci tzv. DNA barcoding, neboli čárový kód na základě kousku DNA. Představit si to je poměrně jednoduché, řetízek DNA tvoří jen 4 různé báze ve specifickém pořadí, pro jednoduchost si je lze znázornit třeba barevnými korálky na šňůrce, přičemž je tam navlékáme ve zdánlivě náhodném pořadí (ve skutečnosti to pořadí určuje strukturu bílkovin). Pokud bychom to pak z obou stran zducli, tak to vytvoří barevný čárový kód, obdobný tomu černobílému na zboží v každém superhyper. Důležité na tom koumání bylo zjistit, který kousek kterého genu bude zrovna tak proměnlivý, aby se na jeho základě dalo určit, že zkoumaný objekt je třeba ježek východní a ne západní.

Tento rozlišovací kousek DNA, dále mu říkejme standardně „marker“, byl objeven celkem nedávno, v podstatě na přelomu tisíciletí. Předcházela tomu řada studií, které používaly řadu jiných markerů, a když už jich bylo opravdu, ale opravdu hodně, si pár lidí sedlo na zadek a začalo to množství informací třídit, až se jim vyloupl ten dnes používaný DNA barcoding.

Jednou z těch předcházejících studií byla i práce doktorů zoologie/genetiky Bakera a Palumbiho, kteří ve své době měli za cíl najít markery pro velryby. Jak je dobře známo, velryby jsou loveny a pojídány, ovšem je jich čím dál tím méně a mnohým druhům začíná hrozit vyhynutí (vlastně sežrání hladovým druhem Homo sapiens). Mezinárodní velrybářská komise proto požádala oba výše uvedené vědce, aby jim trochu pomohli, neb komisi se přeci jen zdály některé balíčky s masem na asijských trzích podezřelé. Oba kolegové projevili dobrodružného ducha, neboť aby neporušili zákon o zákazu vývozu masa z ohrožených druhů, odcestovali do Japonska s velkým kufrem, v němž bylo zapůjčené „cestovní“ laboratorní vybavení (firma věděla, jak se dělá marketing), a v hotelovém pokoji si udělali provizorní laboratoř. Pak se vypravili na nákupy, a donesli si celou škálu produktů označených „velryba“ od masa sušeného, soleného, marinovaného v sezamovém oleji či sójové omáčce, až po čerstvé řízky. Z tohoto materiálu extrahovali DNA, a pak připravili onen „marker“. Ten už se vyvážet může, takže přesnou sekvenci, tedy pořadí oněch barevných korálků, určily laboratoře na Novém Zélandu a v USA. Nooooo… konec si jistě domyslíte, ze 16ti vzorků jich bylo 5 z chráněných druhů, a další tři pocházely z delfínů a mořské želvy (což se sice asi lovit může, ale klamání zakazníků se přece nedělá). O něco později byla provedena podobná studie ve větším rozsahu, ta už zahrnovala i nákupy z Koreje, a z celkového počtu 954 vzorků jích bylo 773 opravdu z velryb (z toho zhruba 9% z chráněných druhů), zbytek opět z delfínů, želv, ale i ovcí a koňů. Ňam !

DNA Barcoding se tímto a dalšími případy stával stále více populárním, takže dnes existuje obrovská porovnávací databáze, používaná pro ledacos. Ovšem u zrodu tohoto projektu stál pro změnu zoolog/genetik kanadský, dr. Hebert. I jemu se podařil hezký kousek….

V r. 2007 si jedna paní v Chicagu koupila na asijském tržišti dvě mražené ryby („ďas mořský”), a uvařila z nich rodince dobrou polívčičku (příprava zahrnovala očištění, vykuchání a 7 hodin máčení ve studené vodě). Paní si dala pořádný nášup, manžel i dcerka si dali pár misek (dcerka spíš jen mističku), načež se rodičům udělalo velmi nedobře. Paní zvracející, s otupělostí a brněním v okolí úst, celkovou slabostí a bolestí na hrudníku přijali do nemocnice, manžel měl naštěstí příznaky slabší, takže byl ponechán v domácí léčbě, dcera byla bez příznaků. I začalo horečnaté hledání zdroje nemoci, takže byly zbytky kůže a vnitřnosti podrobeny chemické analýze; vyšetřování se zaměřovalo na tetrodotoxin, obávaný nervový jed. Samozřejmě že se do toho vložil federální zemědělský úřad, který má mimo jiné v popisu práce také dohlížet na kvalitu dovážených potravin. I strhla se mela převeliká, prací téměř detektivní byl zjištěn prodavač i další ochody, které obdržely stejnou či obdobnou zásilku s nevinným označením „ďas mořský, vykuchaný a bez hlav, vyprodukováno v Číně“. Kromě chemiků ty zmraženiny posuzovali i zoologové taxonomičtí, ale došlo i na dr. Heberta. Jemu byly zaslány rozvařené zbytky masa z oné polévky…. a mělo to dobrý konec, neboť i on na základě genetického markeru potvrdil podezření ostatních zúčastněných, že šlo o jedovaté čtverzubce, v Japonsku známé jako poněkud adrenalinová mlsota „fugu“. Paní se uzdravila po třech týdnech, manžel mnohem dříve, a dr. Hebert dnes stojí v čele nadnárodního konsorcia pro DNA Barcoding s cílem přidělit kódy všemu živému, co na této planetě pobíhá. Databáze je dnes obrovská, ale ukazuje se, že platí jen na živočichy, a ještě ne všechny. Ale nebojte se, pracuje se i na markerech pro další organismy, takže ve tmě tápat nebudeme.

A teď hezky do postýlek…. vlastně ne, pokud byste měli zájem nebo vás trápil nějaký prťavý živočich, kterého lze odchytit a v lihu zaslat k analýze, můžete se mi ozvat – tuhle identifikaci děláme s mými studenty v rámci výuky, a mnohdy je to rychlejší, než se dopídit specialisty taxonoma na tu či onu zvířecí skupinu (neboť na rozdíl od něho genetici neběhají v terénu mimo dosah signálu).

 

PS.

Oba uvedené případy jsou zdokumentované v odborných publikacích, pdf v AJ je volně k získání a mohu přeposlat.

Příspěvek byl publikován v rubrice Nezařazené a jeho autorem je Šumavák. Můžete si jeho odkaz uložit mezi své oblíbené záložky nebo ho sdílet s přáteli.

839 komentářů u „Veselé historky genetické, nejen pro Ptakopyska“

  1. Šumaváku: no tak to jsme v prdeli. Viz poslední odstavec v 747.

  2. I když mně částečně uklidňuje, že přesun části ruských leteckých sil na provisorně vybudované základny v Německu by nejspíš též neunikl pozornosti.

    🙂 Přesně tenhle scénář moc hezky pojednává kniha „Obchodní válka“ od Larry Bonda. Včetně toho, že průser začne zhroucením sociálního státu ve Francii, Španělsku a Německu. Kdo nečetl, vřele doporučuju pro dlouhé zimní večery.

  3. I když tedy musím uznat, že autor si jak Čechy, tak nejspíš Poláky blbě idealisuje, protože v knize jaksi potají jak české, tak polské vlády ulévají ročně cca. 10% HDP do zbrojení a následkem toho překvapí zcela netušenou výzbrojí spojené německo-ruské jednotky zhruba na linii Labe a zastaví jejich postup natolik, že US Army stihne najít prdel vlastníma rukama a zakročit.
    Něco takového lze bohužel v praxi jen obtížně očekávát, když každý pyskuje jestli potřebujeme obrněné transportéry, stíhačky a jestli nejsou ty nové pušky moc drahé…

  4. 747- no tak pokud má někdo obavy, že nás sežere EU, jistě nemá na mysli že se tak stane vojenskou operací.
    No a já mám obavy, aby nás stylem obchod-vstřícnost-vydírání nesežrali spíš ti rusáci.

    Tanky jsem tentokrát fakt neměla na mysli.

  5. Andy: tak na obchod musí být dvě strany, že ano. Jedna která něco kupuje a druhá, která něco prodává. Transakce je navíc učiněna jaksi dobrovolně.

    Pokud vyjdeme z vřeštění levice o vytunelovaném státu, který víceméně nic nevlastní, tak by se eventuálně jednalo o čistě soukromé transakce soukromých subjektů, po kterých je každému kulové.

    Pokud by toho stát vlastnil naopak až tak moc, že by při prodeji Rusákům hrozilo „sežrání“, tak se nejspíš ten socík za posledních 23 let moc nezměnil a většina majetku je tak nějak ve vlastnictví všeholidu. Pak ovšem nechápu, proč všeholid tak ječí, že nám tu nic nepatří… 🙂

  6. 2 Pavel Kořenský – ad 695 – tak jsem si ty signatáře prošel… Mnohé znám a nic jiného bych od nich nečekal… Takže asi tak…

  7. Připravte si žaludky na zítra. Je připraven veřejný dopis učitelů PORGU, žádajících hlavu Klause jr., za urážku starostenské nohy, eh, čo hovorím, „řečové vady“ svatého karla, Zeman lhal, že byl ve svazcích STB veden jako nepřátelská osoba, byl prý pouze „sledovaná“ osoba, dále výsměch Fischerovi, ze kterého konečně vypadl jakýsi názor, ale samozřejmě zas „nesprávný“. Všichni „chápou“ chudáka Stránského, že toho Dejdara prostě v rozčilení vyhodit musel, nejvíc Horáček s Pilipem a Wagnerovou.
    A na závěr vyjádření „renomovaného“ novináře: Petr Honzejk statistika nuda je, honza fischer …da je….

  8. Dobré ránko!

    Zatímco obsazení Kotlinky Landsmanchaftem by bylo přece jen složitější a nějakou chvíli trvalo, tak Kalouska s Bakalou máme přímo za zadkem a Fajmonovy obavy jsou, řekla bych, zcela na místě.

    …Europoslanec je znepokojen i Schwarzenbergovými vazbami na Miroslava Kalouska a uhlobarona Zdeňka Bakalu. „Schwarzenberg na Hradě rovná se ovládnutí České národní banky Kalouskem a Bakalou. To je přímé ohrožení české suverenity a ekonomické stability a hospodářských zájmů státu. Schwarzenberg podporuje bankovní unii, která znamená, že EU a zahraniční matky vysají peníze českých střadatelů do zahraničí,“ varuje Fajmon….
    http://www.parlamentnilisty.cz/rss/zpravy/Klaus-se-zle-vyjadril-o-ODS-a-zastal-se-sveho-syna-260301

  9. Dobré ráno.
    Rputi, je asi dobře, že se politici snaží být lidoví. Ale měli by být rozumní a čitelní. A neurážet zbytečně protivníka.
    Kde se učili řemeslo?

  10. nickname, souhlas.
    Leč …. stejně jako my jsou součástí této společnosti.
    Máte pocit, že tu vládne tolerance k odlišným názorům a nepadají zcela zbytečné urážky? Proč by ti politici měli být jiní?

  11. 761 Co si ve fabrice může dovolit dělník, si nesmí dovolit mistr. V dobré fabrice.
    Ještěže na facebooku nemám mnoho přátel, ti by mě zastřelili 🙂
    Dělám diverzi v čistě pro-KS vodách.

    Jestli máte kontakt na Miloše, nebo na Václava, tak prosím ať se klidní. Jinak Miloš nemůže vyhrát.

    Leoš Tržil navrhuje vykácet stromy podél silnic. Zakázat řidičům jezdit po silničních komunikacích. 🙂

  12. nickname, taky by se měly zbourat všechny domy kolem silnic – zdi jsou strašně nebezpečný 🙂

  13. http://neviditelnypes.lidovky.cz/politika-navrat-tunelare-jedi-dko-/p_politika.asp?c=A130119_105502_p_politika_wag

    Koukám, tady se také objevil hnusný a odporný pomlouvač ctihodného knížepána.

    Pepoši, nevšiml jsem si, že by tě někdo kádroval. Pouze se tu objevily názory s tvými nekorespondující. Ale tak to má snad být, ne? Nikdo ti nebrání je hájit do roztrhání těla(tedy doufám tvého). Ale pak se nediv, že ti někdo oklikou řekne, že jsi alternativní. Ale i to se dá vydržet. Stačí změnit téma. Na druhou stranu víte, jaká by tu byla hrůza, kdybychom všichni souzněli?

  14. (717) Na tom, že Zeman je pro mne absolutně nevolitelný, nemůže Klaus změnit lautr nic.

  15. 766 Bude-li každý z nás z křemene, pak celý národ z kvádrů. Nebudeme se muset zabývat vyhledáváním kádrů.

  16. (729) Ve vesnici většinově cikánské není řešením jakýkoliv běžný způsob či nezpůsob volby.
    Ledaže by zafungovalo, že ten nepřímý je pro cikány příliš složitý na přdstavivost, ale moc na to nevěřím.

  17. (737)“ Československo odsun nezpůsobilo a nemá za něj odpovědnost.“
    To bych se dost divil, že by to ti Spojenci vymysleli sami, když tím byl Beneš celou válku dost posedlý a pilně na tom pracoval.
    Bez souhlasu Spojenců to nešlo, to ano.
    Odpovědnost, jde o to jakou. Právní možná ne. Dle mého ovšem suveréní stát má vždy zodpovědnost za to, co se na jeho území a s jeho obyvateli děje. S tou suverenitou to bylo vachrlaté, ale moc ji naše vláda neprosazovala.

  18. (755)„Transakce je navíc učiněna jaksi dobrovolně.“
    Nemám dojem, že by přeslavná EU podporovala zrovna tuhle stránku ekonomiky.

  19. Ahoj! No to Fajmon nedotáhl do konce( já to teda celé nečetl)- ještě měl dodat jména.
    Živě vidím, jak KS jmenuje do čela banovní rady ČNB to nejlepší, co v současné době máme: Sedláčka!

    a jsme v hajzlu….

  20. (758) No jo, ale co Zeman? Jeho kamoši také nic moc.

  21. Ajrovko, sem už psala – jsem na tom jak ten Macek – jednoho volit nechci, druhého nemohu. Stejně dobře se mě můžeš ptát, jestli se zítra oběsím nebo skočím z mostu – já ti fakt nevím … 🙂

  22. Pohraničník – politruk Václav Sloup z KSČ, nyní radní za školství, se nemá za co stydět.

  23. Šumaváku, v hajzlu jsme v každém případě, ale je to jako volit mezi latrínou a splachovacím…

  24. Dobré ráno,

    tak se nám po ránu ucpala Malá Strana. No, aspoň jsem měla více zdravého pohybu.

    Niko,

    myslím, že mladej Klaus ustřelil. Nechal se vyprovokovat a mohl si spočítat, že jeho odpověď bude pro Mafru sousto. Poslat do kélu je mohl i bez toho, aby tam tahal volby.

    Niméně to nic nemění na tom, že Klaus poslal obchodní dopis, který nebyl určen ke zveřejnění a byla to MAfra, kdo z toho udělal zveřejněním odmítnutí politického významu.

    Myslím, že řada lidí volí knížete ne pro knížete, ale z nenávisti vůči Klausovi. Všichni pod tím Klausem tak strašně trpíííí a až nebude na hradě, nepochybně se jim uleví.

  25. A zrovna mi dorazil od spolužačky mail, že dcera povila vnuka.

    život jde svým tempem a kašle na volby 🙂

    A co u Vás, nickname?

  26. zdravím ! Pořád tady omílám dokola, že historie se opakuje, ale má ty nejpitomější žáky 🙁 Tak tedy znovu k odsunu Němců a té trapné poznámce KS ( nikoliv Jeho Jasnosti, abych nerozčílila Andy :-?): kdyby KS znal historii, tak by k Benešovi přiřadil knížete Spytihněva, který r.1055 provedl odsun Němců z českých zemí naprosto „dočista“ ( „…On si hned prvního dne,kdsy byl nastolen, velikou, podivuhodnou a po všechny věky pamětihodnou zjednal památku,neboť kolikkoli bylo nalezeno z rodu německého,ať bohatých nebo chudých nebo poutníků,kázal najednou do tří dnů vyhostiti ze země české; ba ani své matce … dceři Otově, nedovolil tu zůstati“ (Kronika Kosmova XIV). Pochybuji, že si k tomu vyžádal souhlas „mocnosti“ , že přihlédl k remcání všeholidu anebo že nějaké dodatečně odškodnil ( restituoval ) 😕
    V té době ovšem byla výhoda, že převážná většina lidu neuměla číst a že neexistovala masmédia 🙂
    Není ovšem nutno ani sahat tak daleko do historie: jednak pod pojmem „odsun“ je těm současným zapomětlivým a pitomcům sugerováno, že stejně jako v r.1055 byli i v r.1945 odsunuti všichni Němci; tak to, tedy, panstvo, nikoliv ! 😕 Zůstalo tady v Sudetech hafo německých rodin, a z těch ti Němci a Maďaři, kteří byli v r.1945 vyvlastněni na základě BD ,a podařilo se jim do r.1953 získat čsl.občanství , byli v posametové euforii odškodněni ( zákon ČNR 243/1992 Sb.,který de facto prolomil BD ):-?

  27. Já mám dovolenou, žehlím, v nemocnici je zákaz návštěv, tak na sálu asi nebudu moci být.
    Ještě není první doba. Možná to jsou poslíčci, uvidíme.

  28. (781) tedy přesněji „prolomil hranici r.1948“

  29. Tož ať už se to ptactvo neulejvá, nickname. 🙂
    Moje obě děti se narodily pár dní před termínem a rozhodně jsem si nestěžovala, že mi to očekávání bylo zkráceno.

    Víte, jetsli přiletí čáp nebo vrána?

  30. Jedna vrána tady poletuje. 🙂 Včera jsme ještě byli na procházce, možná jsme to urychlili.

  31. nickname, poslíčci jsou cca 3 týdny před porodem.

  32. 786 Uvidíme, už jsme po termínu, když by malá nechtěla ven do týdne, tak by vyvolali porod. Nejsou to kontrakce, nejsou to poslíčci, co to je?

  33. a ještě jedno doplnění k té „sudetské otázce“ : při „prolézání“ archivů jsem na vlastní oči viděla a četla říšský zákon z r.1939, podepsaný Hitlerem, kterým obyvatelům Sudet bylo umožněno optovat buď k české nebo německé národnosti – co znamenala jejich volba, nechávám vaší představitosti 😕

  34. zase čtu špatně – pepa včera napsal – 616 – že Dana a tučňák měli ve svých připomínkách pravdu a proto toho už nechá, asi tím myslel psaní komentářů. Protože se válí v posteli, tak to nevydržel a přiznal se k tomu, že porušil slib.

    Co jste si z těchto jednoduchých vět dokázali vydedukovat, to přesahuje obzory mojí jednoduché palice.

    Celou noc drobně, ale vytrvale sněžilo a včerejší ledovka se pokryla vrstvičkou sněhu. Ideální podklad pro školu smyků – jen se to moc nehodí na silnici. Chudáci sanitkáři a hasiči – jezdí skoro pořád ve dvojicích. Sanitkáři obvazují a hasiči tahají vozidla z příkopů. Bohužel jsem musel na silnici taky.

  35. ad 788 – No a jedni z nich k tomu vykřikovali:“Heim ins Reich!“ a když jim bylo vyhověno, byli zase nespokojeni.
    A slyšeli jste třeba někdy o odsunu Němců z Dánska? Nějaké požadavky na vracení majetku, stesk po domově? Právo na sebeurčení ? Ne? Čím to asi bylo…
    A ještě poměrně do nedávna – upřímně teď nevím, zd a se díky EU podmínky nezměnily – tam měli Němci úplný zákaz nakupovat nemovitosti.
    A možná se po tom odsunu o to ani moc nesnažili.

  36. AK – ad 771 – Ten Beneš musel být opravdu vtělený ďábel, když zařídil odsun Němců i z Polska, Norska , Dánska, Francie, Holandska… stačilo mu mrknout levým víčkem a spojenci skákali jak pískal.
    Neuvěřitelné!
    😉

  37. . . . me se libi jak dneska vsichni vedi, ze kdyz nemci ze sudet kriceli „Heim ins Reich“ , tak to mysleli naprosto vazne ,a byle jim treba vyhovet, kdezto kdyz jsme my cesi kriceli napriklad na Prvnino maje „Se SSSR na vecne casy“ tak to bylo pouze „jako“. . . 😉

  38. Šumaváku, zvláštní, že tehdejší představitele Polska, Dánska, atd. nikdo do Haagu hnát nechce ….. ba ani o tom nemluví …. 🙂

  39. Beneš byl skromnej chlapec, když byl za vá lky u stalina, tak mu tent o položil na stůl mapu střední Evropy a tužku, ať si nakreslí kolik chce ubrat z Německa, aby se Československo líp bránilo.
    A Beneš nechtěl…

  40. brouku, vážnost těch výkřiků byla sem tam podtržena nějakou tou českou mrtvolkou …
    To se na 1.máje teda fakt nedělo! 🙂

  41. 794-myslím, že v Polsku platí výrok opakovaný všemi představiteli, že jakýkoliv pokus o revizi výsledků 2. světové války bude znamenat novou válku ?

  42. 793 brouku, vy jste křičel? 😉
    Nevím jestli si pamatujete, jak paní Pezoldová vysoudila rodinnou hrobku (u Třeboně? u Světa?). Jednou z podmínek adopce (resp. dědictví) mělo být, že se pan Karel S. zasadí o to, aby rodu byly vráceny majetky hlubocké větve. O to se prý nezasadil, a tak by paní Pezoldová měla mít nárok na vrácení dědictví. Co se stane, až pan Schw. bude prezidentem? Bude usilovat o zrušení/obejití Lex Schw.?
    Jen tak přemýšlím, co bude panu KS bližší? Dědictví nebo ústavní pořádek?
    Asi to pošlu jako téma panu AB Bartošovi 🙂

  43. 795 Zdá se, že Beneš i Kléma znali Stalina moc dobře. A snažili se zalíbit. Věděli, co se stalo Tuchačevskému. A Sikorskému.

  44. 798- Asi to pošlu jako téma panu AB Bartošovi“

    To je dobrý nápad, alespoň nebude mít čas na psaní těch svých antisemitských sraček.

Komentáře nejsou povoleny.